Gebirgketten, Horste und Beckenlandschaften prägen Makedonien. Die Gebirgsketten haben durch eiszeitliche Gletscher und tektonische Prozesse ein Hochgebirgsrelief. Im Osten und Nordosten wird das Land vom Ägäischen Meer und den Flüssen Nestos und Struma begrenzt. Im Norden liegt das große Einzugsgebiet des Vardar-Flusses. Im Westen erstrecken sich die albanischen Randgebirge und im Süden bilden die Bergmassive des Grammos und des Olymp die Grenze. Im Südwesten liegen die zwei großen Seen Ohridsee und Prespasee.