In Malawi herrscht tropisch-wechselfeuchtes Klima. Im Hochland betragen die Temperaturen 18 bis 22°C, in der Grabensenke 25°C. Innerhalb der Regionen gibt es kaum Temperaturschwankungen.

In der Regenzeit - von November bis März - ist es auch am wärmsten. Im Norden fallen bis 1.500 mm (teils sogar bis 3.000 mm) Niederschlag, im Süden weniger als 1.000 mm und im Grabenbereich sind es gar nur 600 mm.