Der tropische Regenwald, der etwa 70% der Oberfläche bedeckt, geht mit zunehmender Höhe in Berg- und Nebelwälder über. An den Küstenebenen gedeihen Mangrove- und Sumpfwälder, sie machen 20% der Landesfläche aus. Jedoch sind die Waldbestände durch intensive Rodungen teils stark gefährdet. In Malaysia wachsen verschiedene Fleisch fressende Pflanzen. In der Tierwelt finden sich vereinzelt Elefanten, Tiger Panther, sowie seltene Schuppentiere und Fisch- und Mamorkatzen. Typische und häufiger anzutreffende Tiere sind die Malaienbären, Tapire, Gibbons, Krokodile, Kobras und Pythons. Die Vogelwelt ist äußerst vielfältig, u.a. lebt hier der Nashornvogel.